SliceOmatic, é um software de análise de imagens médicas fácil de usar, poderoso e acessível que aumenta a capacidade dos pesquisadores de medir, segmentar e analisar dados de scanners multi-slice.
sliceOmaticfoi desenvolvido para pesquisadores em Composição Corporal. Sua evolução é baseada em anos de colaboração entre os programadores e os pesquisadores que o utilizam.

SliceOmatic oferece o melhor processo de segmentação até hoje. Anteriormente, a segmentação com a modalidade MRI (Ressonância Magnética) era uma tarefa altamente trabalhosa. Com o sliceOmatic, os operadores morfológicos podem realizar a segmentação de tecidos sem esforço. Além disso, estudos comprovam que essa técnica está gerando resultados consistentes.

NOVO: AI com Python - Um módulo de aprendizado profundo para segmentar qualquer fatia em qualquer modalidade.

Os novos módulos AI com Python permitem que você treine sua própria IA com suas próprias imagens. A interface gráfica torna o treinamento fácil e intuitivo para qualquer novato em IA, além de permitir que usuários avançados personalizem o código python usado para os modelos de IA e suas métricas. Depois de treinar sua IA, você pode usá-la para segmentar imagens em até 20 ms. por fatia com um cartão Nvidia (cerca de 10 vezes mais lento sem).

Mas não acredite em nossa palavra, baixe o sliceOmatic deste site e experimente você mesmo! Sem uma licença, o programa tem algumas limitações (não permite que você salve nenhum resultado), mas você pode dar uma olhada e ver como é fácil segmentar seus dados com ele.

É usado por clientes satisfeitos em todo o mundo:

O módulo AI com Python:

Este módulo está incluído no sliceOmatic.

O módulo AI with Python é um módulo que permite treinar sua própria IA com seus dados. O módulo AI pode ser usado para segmentar imagens com pesos AI treinados predefinidos. Se nenhum dos pesos pré-treinados disponíveis corresponder aos seus requisitos, você pode treinar sua própria IA com seus próprios dados diretamente neste módulo. Tudo o que você precisa para treinar uma IA é fornecido. Basta seguir algumas etapas simples de configuração, iniciar o treinamento, esperar que ele termine (essa etapa pode exigir um pouco de paciência...), salvar os pesos resultantes e usar a IA recém-treinada para segmentar suas imagens. Você pode usar esse processo iterativamente. Primeiro, faça algumas imagens manualmente ou semiautomaticamente com a interface padrão do sliceO e, em seguida, treine uma IA com essas poucas imagens. Use a IA treinada como um primeiro passo em seu processo de segmentação, corrigindo quaisquer erros com os vários módulos de segmentação sliceO. Então, quando você tiver mais imagens, treine novamente a IA. Eventualmente, sua IA será boa o suficiente para fazer a segmentação de suas imagens automaticamente. Se você estiver familiarizado com as tecnologias de IA e puder codificar em Python, o módulo permite personalizar os modelos e métricas de IA como desejar. . O módulo ABACS: O módulo ABACS, é um plugin criado pela Voronoi Health Analytics . O módulo ABACS faz uma segmentação automática de cortes CT no nível T4 ou L3. Com o simples clique de um botão, o módulo ABACS (Analisador Automatizado de Composição Corporal usando Segmentação de Imagens de Tomografia Computadorizada) identificará e marcará a gordura muscular, subcutânea, visceral e intra-abdominal em todas as fatias L3 ou T4 que você selecionou, sem qualquer outra intervenção do usuário.

Especificação:

As ferramentas usuais:

 SliceOmatic tem, é claro, todas as ferramentas usuais que qualquer bom programa de análise de imagem deve oferecer. Isso inclui ferramentas para visualizar as imagens em qualquer direção em várias janelas, ferramentas para filtrar as imagens, ferramentas para medir distâncias, ângulos e superfícies nas imagens e muito mais coisas "básicas".







Segmentação do SliceOmatic:

O processo de identificação de cada tecido dentro de uma imagem é conhecido como "segmentação". E é aqui que o sliceOmatic supera a concorrência: suas ferramentas de segmentação.

O sliceOmatic equilibra poderosas ferramentas de segmentação com uma interface altamente interativa, permitindo que você controle completamente o processo de segmentação.

Diferentes modalidades ou mesmo diferentes tecidos dentro da mesma fatia são melhor segmentados com diferentes técnicas. O SliceOmatic facilita o uso da técnica apropriada para cada tarefa específica. Por exemplo, em uma fatia de ressonância magnética do abdômen, você pode usar a morfologia matemática para segmentar a gordura subcutânea e o crescimento da região para segmentar a gordura intra-abdominal.




sliceOmatic é uma ferramenta de pesquisa:

Como pesquisador, analisar as imagens é apenas um meio para um fim. O que você realmente deseja é obter volumes anatômicos precisos. SliceOmatic é projetado como uma ferramenta de pesquisa. Além de ajudá-lo a criar as ótimas imagens para esses slides "uau" em suas apresentações, ele exportará as superfícies e volumes de cada tecido segmentado em um arquivo compatível com planilhas.




sliceOmatic e Biomecânica:

Talvez sua área de pesquisa seja a biomecânica? Então você vai querer usar o sliceOmatic para criar malhas poligonais e/ou linhas de contorno a partir dos dados segmentados. Estes podem então ser exportados em vários formatos padrão para serem usados ​​na análise de elementos finitos ou para criar modelos estereolitográficos.










Obtendo valores precisos mais rapidamente:

 Em uma publicação técnica, o Dr. Bonekamp e seus colegas compararam o sliceOmatic com outros 4 pacotes de análise de imagem. Eles não apenas descobriram que o sliceOmatic estava entre os mais fáceis de usar e tinham a melhor interface gráfica do usuário, mas também descobriram que segmentar gordura adiposa e visceral com sliceOmatic era pelo menos 3 vezes mais rápido do que com qualquer outro software.







Tempo médio para medir 10 fatias (min)*

sliceOmatic	NIHImage	Analisar	Hipofat	EasyVision
32	322,5	100	120	97,5

* De: S Bonekamp, ​​P Ghosh, S Crawford et all, Comparação quantitativa e avaliação de pacotes de software para avaliação da distribuição do tecido adiposo abdominal por ressonância magnética , Int J of Obesity , 32: pp.104, 2008

Dimensões da Embalagem (Largura X Altura X Profundidade): 10 x 2 x 12 cm

Peso do produto: 0,1 kg

Conteúdo da Embalagem:

Módulos Adicionais

A nova estrutura do SliceOmatic foi projetada para permitir fácil integração com novos módulos. Qualquer pessoa que use o SDK gratuito fornecido nas páginas de download pode adicionar módulos ao programa.







Vários desses novos módulos podem ser baixados das páginas do nosso site. Alguns deles são apresentados mais abaixo. Para uma lista mais exaustiva, consulte o manual online.







Se você deseja adicionar um módulo ao programa, informe-nos e forneceremos toda a ajuda necessária.







Alguns dos Módulos Adicionais disponíveis:
• FERRAMENTA: AUTOMAÇÃO
• FERRAMENTA: GRADIENTE CT
• FERRAMENTA: COMPARAÇÃO DICOM
• FERRAMENTA: INFORMAÇÕES DICOM
• FERRAMENTA: INTERPOLAÇÃO DE PIXEL
• CLASSE: FRONTEIRA
• CLASSE: CLONE
• AULA: AMPLIFICAÇÃO GRADIENTE
• CLASSE: RR2D
• CLASSE: RR3D
• MODO: SEGMENTAÇÃO DE HISTOGRAMA
• MODO: INTERPOLAÇÃO DE TAG
• MODO: ESPECTROSCOPIA DE RM
Ferramenta: Automação
Esta ferramenta permite automatizar algumas ações. Ele pode ser usado para ler arquivos e executar scripts para cada arquivo, executar scripts para cada quadro ou simplesmente executar scripts várias vezes. Por exemplo, pode ser usado para tirar um instantâneo de cada quadro, ou para criar uma animação de um objeto 3D girando, ou em um ambiente industrial, automatizar a análise de imagens adquiridas de um processo contínuo.

Para obter mais informações, consulte o manual do usuário online sliceOmatic 5.0





Ferramenta: Gradiente CT
Essa ferramenta é usada para limitar o cálculo do gradiente a uma faixa limite.

Alguns dos modos de segmentação (Morpho Á Snakes) são baseados no gradiente dos valores de pixel. Para imagens de TC, também podemos limitar o cálculo do gradiente a um limite desejado, o que nos dá uma melhor segmentação.

Para obter mais informações, consulte o manual do usuário online sliceOmatic 5.0